“气液升降如天地之阴阳，肝肺传导若日月之往复。”（《钟吕传集》）总之，“法天象地”，为天地之缩影，而天地，也可看作身之放大，所谓“天法象，法象天”（《真气还元铭》）。天地有神明主宰，身中各部位也皆有神居住职掌。《黄庭经》等列举身中诸神名讳、形貌、肤色，谓居于脑中泥丸宫太帝君，为身中诸神统帅，身诸神，为天地诸神缩影。这种天合论，可谓种独具特色生命全息论。 
      
      教对形神关系颇有研讨，般认为形神相互依存，而神为主宰，功用殊胜。《太平经》曰：“形者乃主死，精神者乃主生。常合即吉，去则凶。”强调精神为生命主要因素。《抱朴子·至理》说：“夫有因无而生焉，形须神而立焉，有者，无之宫也；形者，神之宅也。”像无形、“”居住于有形世界，无形精神居住于身中，为生命之本原。《太平经》还以神、气、形以命大要素，比喻说：“故形体为家也，以气为舆马，精神为长吏”，若形体家宅中缺了精神，像田宅城郭没有官吏主宰治理，便会乱了套。教还指出精神在身中居止之处脑，与身之精主宰太帝君所居处致。也有神在于心之说。 
      
      形神从另角度或深层次，称为魂魄。《太清真络命诀》承华夏传统魂为神、魄为形之说，谓“死魂去，魄独在，形魄归土中，魂上天去。”魂为阳精，魄为阴精，如天上日月，“在天为日月，在为魂魄”。魂居处肝，魄居处肺。魂魄，当种能产生精神与形体生命活动本原、实体，分为魂魄。《太上老君内观经》说在胎中时，“月阳神为魂，动以生也；月阴灵为魄，静镇形也。”魂魄还被说成种具外在性、有如鬼神东西。《云笈签》卷载张陵言：身魂，名胎光，为太清阳和之气，属之于天，令心清静，绝秽乱之想，为延寿添算，主命；名爽灵，乃阴气之变，属于行，使机谋思虑，多生祸福灾衰刑害之事，主财禄；名幽精，阴气之杂，属于地，使好色嗜欲，秽乱贪睡，主灾衰。魂又称命，胎光常居本属宫宿，爽灵居地府岳，幽精居水府。魂中，爽灵、幽精魂孳生机心与贪欲，令劳神耗气，精气枯竭，“名生黑簿，鬼录罪著，死将至矣。”魄则为身中阴气、浊鬼，其名为尸狗、伏矢、雀阴、吞贼、非毒、除秽、臭肺，主生理功能。魂说对精神、心理、生理活动种独特分析体系，其旨归在说明清静寡欲乃养生延寿之要。 
      
      形神关系从更深层次观察，为精气神、性命关系。原始经《太平经》即以精、气、神为生命大要素，谓者本天、地、之气，“神者受之于天，精者受之于地，气者受之于中和”，者“共位”，“相与共为”，结合为体，互能离，“相助为治”，以“爱气尊神重精”为养生延寿之要。精气神又称“”、“宝”，内丹学称为能炼金丹、令超生脱死上药，《心印妙经》云：“上药品：神与气精”。神功用主宰智照，气作用运动流行，精作用生长化育。唐宋以来内丹学更分精气神为后天与先天，强调唯先天精气神—名元精、元气（炁）、元神，方可作炼成内丹大药。先天精气神中，元精元气合称为“命”（生命之本），元神称为“性”（精神本原、本体）。先天精气神，主要根据气功静定中主观体验而建立，当心念寂定动，返归先天，离杂念干扰，超越阴阳行时，斯际念生、寂照动心为元神，充溢身中为元气，气运动为元精。元神居处在脑，元气、元精根本在肾，所谓“顶为性根，脐为命蒂”。（丘处机《大丹直指》） 
      
      内丹学认为，先天精气神与后天精（交感精）、气（呼吸气）、神（思虑神、识神）为体用关系，先天精气神为本为体，后天精气神为用，“非先天能生后天，非后天能成先天”（《还真集》）。先天精气神又相互依存，共为体，互能离，而神，特具主宰功用，最为重要，张伯端《青华秘文》说神为主、炁为用、精从气；王重阳《授丹阳诀》说性为根，命为蒂，性为主，命为客。 
      
      内丹学还将生命之本分为精、神、魂、意种东西、为水火、木、金、土行之气，分别藏于肾、心、肝、脾藏。行为阴阳交变形态。阴阳交变形态和数量，又常用卦来表示。用坎离卦表真阴真阳，离中生火（神）为真阴，乃性根；坎中生水（精）为真阳，乃命本。性根命本，即先天精气神在后天形体中潜藏，喻为青龙白虎。 
      
      从神为主宰、其用神妙传统立场出发，教断受佛家万法唯心说影响，越来越重视心、神。南北朝所出书中，便像佛教样，将众生生死轮回原因归诸于自心。《济众经》说：“种絪熅（行），聚而成体，会其宿业，因而受识，轮转其神，有其生也。因识受染，流入恶缘。”谓因宿世心识受污染，才因宿业而投胎受生。《太上老君内观经》说：“以难伏，唯在于心，心若清净，则万祸生，所以流浪生死，沉沦恶，皆由心也。”该经甚至把心等同于出生、主宰万物，本生灭最高存在：“者，有而无形，无而有情，变化测，通神群生，在之身则为神明，所谓心也。所以教修则修心也，教修心则修也。”教对认识，也从身小天地有无形主宰，类推出宇宙大天地有无形宇宙精神为主宰。后来内丹学对心、神作了进步分析，从本体论、体用论再度分开后天识神与先天元神，或妄心与真心，只以元神、真心为“本来真性”，此物本生灭，超出生死，为、金丹同义语。其说与禅宗心性论甚为相近，教中亦常和会释教乃至儒释教心性说，说元神、真性，教称为、金丹，释氏称为圆觉，儒家名为太极，本物，“天下无，圣无心”。其受佛家尤禅宗影响之迹，灼然可见。 
      
      从养气炼形到性命双修、以性兼命 
      
      早期教从为元气哲学立场出发，在宗教实践上注重养气炼形，追求肉体长生显效。其修炼方法，综合了华夏传统仙、养生术，有服饵、服气、辟谷、行气（闭息）、导引、按摩、叩齿、咽津、存思等多种花样，主要从调制身体和呼吸及外服丹药入手，当然也重视心意调摄，强调清静离欲。大概因养气炼形类方法长生实验失败和理想，促使教渐重修心，从先秦家老庄守静、守心、坐忘、心斋等炼神之出发，融摄吸收佛家擅长修心之。《西升经》即重养神而轻养形，有云：“伪养形，真养神，真神通，能亡能存，神能飞形，并能移山，形为灰土，其何识焉！”该经所倡“守”之，以调心令合于，以调心令合于之虚无体性为要。后来书中所述坐忘、心斋、定观等，皆强调离绝妄念，以智慧观察身、心、物之空无虚幻，令心寂定动，乃至“寂无所寂”，与合。受佛家真如昧、实相禅、止观影响非常明显。 
      
      修心炼神与传统养气修命之术结合，唐宋以来以“性命双修”为纲宗内丹之。所谓性命双修，实际教内丹命术与禅宗之禅双修、合修，禅宗影响于教产物。性命双修丹法，依修炼次第，分先命后性后命途。先命后性，为钟吕内丹派南宗张伯端系路线，其修炼先从教调息闭气等方法入手，炼精化炁，炼炁化神，至炼神还虚阶段，参究禅宗，了彻心性，以归于佛家所谓究意空寂之本源为究竟。先性后命，为钟吕内丹派北宗全真王喆系所主，其修炼先参酌禅法，收心炼已，识心见性，然后依所见元性炼精化炁、炼炁化神、炼神还虚。两种丹法，实际上都以修性为主，张伯端强调先须“以性引命”，丘处机谓全真内丹“分性学，分命术”（《长春祖师语录》）。关于识心见性，皆效法禅宗，以“念生”、“对境无心”为诀，还采用了禅宗打坐、参究、圆相、机锋等方式方法。还有种极端之说，参照禅宗以深化老庄心斋坐忘之，认为命在性中，只要迳直做了性或炼神还虚功夫，则以性兼命，精自然化炁，炁自然化神，神自然还虚。这种类似禅法内丹，被奉为“上品丹法”、最上乘”、“顿”法。 
      
      早期教宣扬：修学仙，得上等成，可肉体飞升天界，甚至如晋代许逊，举家拨宅飞升，留下“得，鸡犬升天”俗话；次等者延寿数百千岁而死；下等者尸体如生，爪发潜长，默炼于地下，谓之“太阴炼形”，久之得，尸解者或先为“地下主（地府冥官），久久积功而得成仙。尸解又有棺解（于棺中失其尸体，唯留爪发）、水解、火解、兵解、杖解等多种方式，还有未入殓而夫尸者。内丹学说依丹法修炼，炼精化炁，可成“仙”，百病生，延年益寿；“大药过关”，可成“地仙”，长生住世，寒暑侵；炼炁化神，可成“神仙”，具诸神通，出有入无；神仙传度，济世功圆，上帝诏赴，炼“阳神”弃壳升天为天官，称“天仙”。后来受禅宗影响，说炼神还虚，粉碎虚空，了彻性源，与合真，则永远超出生死，为自己生命主宰乃至自然界万有主宰。